El Colegio de San Luis es un Centro Público de Investigación perteneciente al CONACYT. Tiene por objeto realizar actividades de investigación científica, de enseñanza y extensión académica en el campo de las ciencias sociales y las humanidades, especialmente sobre los procesos sociales y culturales desde las perspectivas histórica, antropológica, regional e internacional.

Desde su fundación, en 2001, el Programa de Estudios Antropológicos (PEA) ha generado conocimiento antropológico y contribuido a interpretar las dinámicas y procesos socioculturales y políticos del centro y norte del país. En 2003 inició el Programa de Maestría en Antropología Social (MAS), con registro en el Padrón Nacional de Posgrados de Calidad (PNPC). La modalidad es escolarizada y abre convocatoria bianual.