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El Plan de Estudios del DEA otorga prioridad al trabajo de campo al cual le brinda permanentemente referentes teóricos, epistemológicos y metodológicos. Asimismo, sobre los datos obtenidos en campo crea condiciones para su reflexión y debate tanto en lo ecológico espacial como en lo temático, aspectos que contribuyen a la elaboración reflexiva de la tesis del doctorante.
Se divide en ocho semestres con cuatro ejes de conocimiento: Teoría, Metodología, Especialización y Seminarios. Para enriquecer el proceso de aprendizaje, el Doctorado en Estudios Antropológicos promueve la movilidad e intercambio de sus alumnos para realizar actividades de investigación o a tomar cursos en otras instituciones educativas.